Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx28Q9CWT6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx28Q9CWT6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms