Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gadd45gip1Q9CR59 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gadd45gip1Q9CR59 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gadd45gip1Q9CR59 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gadd45gip1Q9CR59 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gadd45gip1Q9CR59 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gadd45gip1Q9CR59 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gadd45gip1Q9CR59 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gadd45gip1Q9CR59 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms