Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tsnaxip1Q99P25 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsnaxip1Q99P25 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms