Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ms4a6bQ99N09 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a6bQ99N09 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms