Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rnf17Q99MV7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rnf17Q99MV7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rnf17Q99MV7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms