Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtpbp4Q99ME9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtpbp4Q99ME9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms