Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gps1Q99LD4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gps1Q99LD4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gps1Q99LD4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms