Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Nlgn1Q99K10 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nlgn1Q99K10 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlgn1Q99K10 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms