Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tm4sf4Q91XD3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tm4sf4Q91XD3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tm4sf4Q91XD3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms