Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh2d5Q8JZW5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.1 ms