Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
E4f1Q8CCE9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E4f1Q8CCE9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4f1Q8CCE9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms