Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppfibp1Q8C8U0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfibp1Q8C8U0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp1Q8C8U0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms