Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubqln3Q8C5U9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubqln3Q8C5U9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubqln3Q8C5U9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubqln3Q8C5U9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Ubqln3Q8C5U9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubqln3Q8C5U9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubqln3Q8C5U9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubqln3Q8C5U9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubqln3Q8C5U9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubqln3Q8C5U9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubqln3Q8C5U9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubqln3Q8C5U9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubqln3Q8C5U9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Ubqln3Q8C5U9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Ubqln3Q8C5U9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubqln3Q8C5U9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubqln3Q8C5U9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ubqln3Q8C5U9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ubqln3Q8C5U9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ubqln3Q8C5U9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Ubqln3Q8C5U9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubqln3Q8C5U9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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