Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc30Q8BVF4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc30Q8BVF4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc30Q8BVF4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms