Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Grik4Q8BMF5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grik4Q8BMF5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grik4Q8BMF5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 980.7 ms