Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup214Q80U93 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup214Q80U93 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup214Q80U93 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup214Q80U93 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup214Q80U93 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup214Q80U93 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup214Q80U93 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup214Q80U93 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup214Q80U93 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup214Q80U93 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup214Q80U93 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms