Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SynmQ70IV5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SynmQ70IV5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SynmQ70IV5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SynmQ70IV5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SynmQ70IV5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SynmQ70IV5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SynmQ70IV5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SynmQ70IV5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SynmQ70IV5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SynmQ70IV5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SynmQ70IV5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SynmQ70IV5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SynmQ70IV5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SynmQ70IV5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SynmQ70IV5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SynmQ70IV5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SynmQ70IV5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SynmQ70IV5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SynmQ70IV5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
SynmQ70IV5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SynmQ70IV5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SynmQ70IV5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SynmQ70IV5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SynmQ70IV5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SynmQ70IV5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SynmQ70IV5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SynmQ70IV5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SynmQ70IV5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SynmQ70IV5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SynmQ70IV5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SynmQ70IV5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SynmQ70IV5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms