Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Neil2Q6R2P8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Neil2Q6R2P8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms