Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ecm29Q6PDI5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ecm29Q6PDI5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecm29Q6PDI5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms