Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt12Q64291 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt12Q64291 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms