Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb6Q60692 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb6Q60692 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms