Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Prdm1Q60636 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm1Q60636 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms