Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc125Q5U465 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc125Q5U465 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc125Q5U465 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc125Q5U465 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc125Q5U465 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc125Q5U465 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc125Q5U465 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc125Q5U465 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms