Protein–RNA interactions for Protein: Q5U452

Trp53rka, MCG14616, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53rkaQ5U452 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Trp53rkaQ5U452 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trp53rkaQ5U452 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms