Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms