Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mdc1Q5PSV9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Mdc1Q5PSV9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mdc1Q5PSV9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms