Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRE5

Proser1, Proline and serine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proser1Q5PRE5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Proser1Q5PRE5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Proser1Q5PRE5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms