Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam20cQ5MJS3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam20cQ5MJS3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam20cQ5MJS3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam20cQ5MJS3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam20cQ5MJS3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam20cQ5MJS3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam20cQ5MJS3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam20cQ5MJS3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam20cQ5MJS3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam20cQ5MJS3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam20cQ5MJS3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam20cQ5MJS3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam20cQ5MJS3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam20cQ5MJS3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam20cQ5MJS3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam20cQ5MJS3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam20cQ5MJS3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam20cQ5MJS3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam20cQ5MJS3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam20cQ5MJS3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam20cQ5MJS3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms