Protein–RNA interactions for Protein: Q5DQR4

Stxbp5l, Syntaxin-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp5lQ5DQR4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp5lQ5DQR4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp5lQ5DQR4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp5lQ5DQR4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp5lQ5DQR4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp5lQ5DQR4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp5lQ5DQR4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp5lQ5DQR4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp5lQ5DQR4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stxbp5lQ5DQR4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stxbp5lQ5DQR4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stxbp5lQ5DQR4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp5lQ5DQR4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stxbp5lQ5DQR4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 356.2 ms