Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmtc2Q56A06 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmtc2Q56A06 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms