Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fam228bQ497Q6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam228bQ497Q6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam228bQ497Q6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms