Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930567H17RikQ3V0K5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930567H17RikQ3V0K5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
4930567H17RikQ3V0K5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms