Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BB287469Q3UT53 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms