Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zscan4fQ3URS2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zscan4fQ3URS2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms