Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctsll3Q3ULP7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctsll3Q3ULP7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctsll3Q3ULP7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctsll3Q3ULP7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctsll3Q3ULP7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctsll3Q3ULP7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctsll3Q3ULP7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctsll3Q3ULP7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctsll3Q3ULP7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctsll3Q3ULP7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctsll3Q3ULP7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctsll3Q3ULP7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctsll3Q3ULP7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctsll3Q3ULP7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctsll3Q3ULP7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctsll3Q3ULP7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctsll3Q3ULP7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctsll3Q3ULP7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctsll3Q3ULP7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctsll3Q3ULP7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctsll3Q3ULP7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctsll3Q3ULP7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctsll3Q3ULP7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctsll3Q3ULP7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctsll3Q3ULP7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctsll3Q3ULP7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctsll3Q3ULP7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctsll3Q3ULP7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctsll3Q3ULP7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctsll3Q3ULP7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms