Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brf2Q3UAW9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brf2Q3UAW9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms