Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ulk3Q3U3Q1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ulk3Q3U3Q1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ulk3Q3U3Q1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms