Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy4Q3TYX8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rufy4Q3TYX8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rufy4Q3TYX8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms