Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrx1Q3TL44 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nlrx1Q3TL44 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nlrx1Q3TL44 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms