Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VrtnQ3SYK4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VrtnQ3SYK4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms