Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ptchd1Q14B62 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ptchd1Q14B62 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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