Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Col17a1Q07563 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Col17a1Q07563 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col17a1Q07563 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Col17a1Q07563 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms