Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdf9Q07105 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gdf9Q07105 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gdf9Q07105 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms