Protein–RNA interactions for Protein: Q01755

Tcp11, T-complex protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp11Q01755 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcp11Q01755 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcp11Q01755 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tcp11Q01755 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms