Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
rp9P97762 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
rp9P97762 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
rp9P97762 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
rp9P97762 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
rp9P97762 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
rp9P97762 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
rp9P97762 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
rp9P97762 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
rp9P97762 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
rp9P97762 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
rp9P97762 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
rp9P97762 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
rp9P97762 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
rp9P97762 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
rp9P97762 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
rp9P97762 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
rp9P97762 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
rp9P97762 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
rp9P97762 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
rp9P97762 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
rp9P97762 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
rp9P97762 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
rp9P97762 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
rp9P97762 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
rp9P97762 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
rp9P97762 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
rp9P97762 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
rp9P97762 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
rp9P97762 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
rp9P97762 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
rp9P97762 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
rp9P97762 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
rp9P97762 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
rp9P97762 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
rp9P97762 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
rp9P97762 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
rp9P97762 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
rp9P97762 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
rp9P97762 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
rp9P97762 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
rp9P97762 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
rp9P97762 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
rp9P97762 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
rp9P97762 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
rp9P97762 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
rp9P97762 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
rp9P97762 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
rp9P97762 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
rp9P97762 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
rp9P97762 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
rp9P97762 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
rp9P97762 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
rp9P97762 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
rp9P97762 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
rp9P97762 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
rp9P97762 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
rp9P97762 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
rp9P97762 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
rp9P97762 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
rp9P97762 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
rp9P97762 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
rp9P97762 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
rp9P97762 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
rp9P97762 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
rp9P97762 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
rp9P97762 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
rp9P97762 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
rp9P97762 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
rp9P97762 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
rp9P97762 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
rp9P97762 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
rp9P97762 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
rp9P97762 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
rp9P97762 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
rp9P97762 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
rp9P97762 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
rp9P97762 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
rp9P97762 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
rp9P97762 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
rp9P97762 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
rp9P97762 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
rp9P97762 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
rp9P97762 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
rp9P97762 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
rp9P97762 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
rp9P97762 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
rp9P97762 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
rp9P97762 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
rp9P97762 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
rp9P97762 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
rp9P97762 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
rp9P97762 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
rp9P97762 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
rp9P97762 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
rp9P97762 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
rp9P97762 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
rp9P97762 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
rp9P97762 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
rp9P97762 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms