Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmklr1P97468 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms