Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfixP70257 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfixP70257 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfixP70257 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfixP70257 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfixP70257 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NfixP70257 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NfixP70257 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NfixP70257 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NfixP70257 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NfixP70257 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NfixP70257 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NfixP70257 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NfixP70257 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfixP70257 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfixP70257 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfixP70257 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfixP70257 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfixP70257 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NfixP70257 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfixP70257 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfixP70257 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfixP70257 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NfixP70257 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfixP70257 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfixP70257 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfixP70257 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NfixP70257 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfixP70257 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfixP70257 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfixP70257 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfixP70257 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NfixP70257 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfixP70257 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfixP70257 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfixP70257 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfixP70257 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfixP70257 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NfixP70257 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfixP70257 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfixP70257 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfixP70257 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfixP70257 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfixP70257 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NfixP70257 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfixP70257 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfixP70257 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfixP70257 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfixP70257 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfixP70257 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfixP70257 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NfixP70257 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NfixP70257 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfixP70257 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfixP70257 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfixP70257 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfixP70257 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfixP70257 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NfixP70257 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfixP70257 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfixP70257 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfixP70257 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfixP70257 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfixP70257 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NfixP70257 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfixP70257 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfixP70257 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfixP70257 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfixP70257 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfixP70257 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfixP70257 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfixP70257 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NfixP70257 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NfixP70257 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfixP70257 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NfixP70257 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfixP70257 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NfixP70257 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfixP70257 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfixP70257 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfixP70257 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfixP70257 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfixP70257 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfixP70257 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfixP70257 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfixP70257 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfixP70257 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NfixP70257 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfixP70257 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NfixP70257 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfixP70257 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfixP70257 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfixP70257 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfixP70257 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfixP70257 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfixP70257 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfixP70257 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfixP70257 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NfixP70257 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NfixP70257 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms