Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps11P62281 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps11P62281 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps11P62281 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps11P62281 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rps11P62281 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps11P62281 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps11P62281 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps11P62281 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps11P62281 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps11P62281 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps11P62281 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps11P62281 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms