Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fgf1P61148 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf1P61148 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.5 ms