Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube2mP61082 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2mP61082 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms